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Só para tomar como exemplo, em 2014 era previsto a entrega de pelo menos 30 km de transportes sobre trilhos, porém nem um terço foi efetivamente entregue. Jurandir Fernandes esteve a frente da secretaria entre 2001 e 2006, e retornou em 2011. A reportagem não dá nome de um possível substituto.
No intervalo entre 2007 e 2010 a pasta foi comandada por José Luiz Portella Pereira, na gestão do ex-governador José Serra. A pasta foi comandada ainda por Aloysio Nunes Ferreira Filho de 1991 a 1992, depois por Fernando Augusto Cunha entre 1992 e 1993. Novamente Aloysio Nunes assumiu em 1993. Depois Jorge Fagalli Neto esteve a frente entre 1994. Logo após Claudio de Senna Frederico assumiu a direção entre 1995 e 2001.